文字列から指定文字を削除

こんばんは。お世話になっております。

先日、http://oshiete1.goo.ne.jp/qa4940684.html こちらにて別ファイルにある文字列を変数に代入することをお教えいただきました。（今回の件とは直接的に関係ないと思うのですが・・）

今回再度質問させて頂きたいのは、変数に代入されているテキスト（改行を含まない一行テキスト）を、違う別のファイルに登録されている単語を削除したい。というものです。

その別ファイル（削除すべき単語が登録されているファイル）は、

1
2
3
、
。

のように登録されていており、削除する際、

//変数、$moto_txtに長文の1行テキストが代入されてる。
$file_name = "./data/key.txt";//排他単語の取得
if(file_exists($file_name)){
　$f_data_array = file($file_name);
　$f_cnt= count($f_data_array);

　for($h=0; $h<$f_cnt; $h++){
　　$delete_key = trim($f_data_array[$h]);
　　$moto_txt = str_replace($delete_key, "", $moto_txt);//
　}
}

のように、削除したい単語が登録されているファイルを単語単位で配列に格納し、for文で$moto_txtからstr_replace()を使って削除しようとすると、何故か他の文字（今確認しているのは、「ア」です）まで削除されてしまう状況となっております。

何か他の方法はないかな？と色々と調べているのですが、その方法が分からず、また、上記の流れで、何故他の単語まで削除されてしまうのかが分かりません。

どんな些細なことでも結構ですので、アドバイスいただけると幸いです。