フケで困っています。。。

いろいろな原因が考えられますので，自分に照らし合わせて判断するようにしてください。

もちろん，一つ一つ，試してみて，効果がありそうな方法をとっても良いですよ。（ただし，方法は一つとは限りませんけどね）

まず，一番最初に考えなければならないのは，シャンプーのすすぎです。
シャンプー剤で洗っても頭皮や髪の毛に付いている汚れを浮かしているだけで，すすぎが悪いとその汚れが残りやすくなってしまいます。
そして，この汚れを餌に真菌などの雑菌が繁殖して，フケの原因となる場合もあります。
また，すすぎ不足によって，シャンプー剤の洗浄成分も頭皮などに残りやすくなり，洗浄成分が持っている脱脂力だけでなく脱水力によって頭皮が乾燥し，フケの原因となっていると考えることも出来ます。
ということで，シャワーでお湯をかけながら，頭皮を洗うようにすすいでみてください。

また，「毎日、ちゃんとシャンプーしているのですが朝起きると頭に細かいフケのようなものがたくさん付いていて」とありますので，頭皮の乾燥不足による乾燥肌のためにフケが出やすくなっていると考えることも出来ます。
私たちの頭皮は角質と言うもので覆われていますが，この角質，タンパク質で出来ていますので，吸水力があります。
そのため，シャンプー後，頭皮を良く乾燥していませんと，角質が水分を吸って膨らみ，角質と角質の間に隙間が出来てしまうようになり，頭皮が乾燥しやすくなってしまいます。
また，角質が膨らむのですから，その分剥がれるようになりますので，さらにフケが出やすくなると考えられます。
これを避けるためには，きちんとドライヤーで乾燥させましょう。
乾燥方法は，このサイトの質問番号：1405332の回答番号：No.5の最後の方に書かれている方法を参考にしてみてください。
ちなみに，（髪の毛が痛みを感じることはありませんが）乾燥が不充分ですと，髪の毛も傷みやすいですよ。

それと，皮脂の分泌量が少なすぎたり多すぎますと，やはり，フケの原因となります。
皮脂の材料は脂質ですから，脂質を抑えた食事をしていますと，フケが出やすくなると考えて良いでしょう。
特に，脂を摂らないようにということで，肉を極力食べないようにしていますと，脂質不足だけでなく，ビタミンB２不足のために皮脂の分泌量が多くなりすぎてしまい，フケが出やすくなっているのかもしれません。（形状は違いますが，脂漏性皮膚炎でも細かいフケが出る場合があるようです）
ビタミンB２は，肉の赤身に多く含まれていますから，豚肉や牛肉の赤身を出来る範囲で摂取するようにしてくださいね。
ちなみに，脂身を取り除いてから調理したり脂身だけを食べ残すようにすれば，ダイエット中でも安心だと思いますよ。（調理に使用する油は，質の良いものを選択することで，摂取しても安心していられるはずです・・・もっとも，摂りすぎては元も子もありませんが・・・）

ストレスが関わっているのでしたら，ビタミンEとビタミンB２の他に，ビタミンCとカルシウムの摂取量に注意してみてください。
いずれもストレスを和らげる効果を持つと言われている栄養です。
また，体質的にアルコールが受け付けない場合を除き，少量のアルコール摂取もストレスを和らげる効果がありますので，時の場合を考え，利用してみてはいかがでしょう。（飲める場合でも（2500÷アルコール度数）ml以上の摂取は避けてください）

他にも原因と対策があるかもしれませんし，また，他の方が書かれている回答が正解かもしれません。
また，場合によっては，医師の診断が必要になることもありますので，あまり長引くようでしたら，これも考慮するようにしてみてくださいね。

美容師です。

フケは２種類あり、乾燥タイプのフケではないかと思います。
脂漏性のフケであれば医師の診断で薬が必要になります。脂漏性のフケは大きいので判断は難しくないと思います。
では、yukina_さんのフケが乾燥タイプを前提にお話します。
乾燥タイプのフケはストレスや生活習慣等が主な原因の様です。
もし、思い当たるストレス原因や生活での原因があればそれを止めればいいのですがそうも出来ない事が多いと思います。どうしても出来ないのであればストレスに強い体作りが必要になります。
手っ取り早い方法はビタミンＥとＢ２を取る事です。
効能は長文になるので割愛しますが、この組み合わせがストレスに強くなるのは間違いないです。それを踏まえた料理は酢豚です。
それと普段の生活に無茶苦茶がないか確認してみて下さい。多くの場合大抵気付かずに無茶をして自分の守備範囲以上に動いている様です。
フケはフケだけの問題ではなく頭皮全体の問題にいずれ発展します。もしかしたら抜け毛も増えてませんか？もし増えていたら上記内容の実行だけでなく育毛も必要になります。
正直yukina_さんの詳しい情報があまりないので以上の事は言えませんが決して難しい内容ではないのでやってみて下さい。
食事と無理のない時間割を心がけてみて下さい。多くの場合これで少しづつ改善しますよ。

体質が変化してシャンプーが合わなくなったのではないでしょうか。

フケ専用のシャンプー剤をしばらく使われた方がいいでしょう。
洗い過ぎもあまりよくありません。

私は春先になるとフケが出ていたのですが、シャンプーコンディショナー使用後美肌水を地肌にすり込むように軽くマッサージするようにしたら治りました。

美肌水情報
http://www.makino-g.jp/yuhobika/drimai/bihadasui …
http://www.ueda.ne.jp/~wkoide/skincare/bihada.html