windows2003でリモートデスクトップから普通のプログラムを常駐させる方法

リモートデスクトップでwindows2003サーバーにリモートログインして自分で作ったプログラムを実行して常駐させたいのですが、ログオフすると動いていたプログラムも消えて無くなってしまいます。
このためログオフせずに×印をクリックしてリモートデスクトップを終わらせているのですが、他の人が同じアカウントで作業をした時に最後に誤ってログオフしてしまうことがあります。
ログオフしてもプログラムが終わらない動かし方はあるでしょうか？
アカウントは運用規定上増やせないので、ログインに使用するアカウントは現在の共有アカウントのみです。

対策が無いようでしたらwindowsサービス型に組み替えようかと思っていますが、改修に時間がかかりそうなので他の対策があれば教えて下さい。