知らない漢字が多すぎる

「難しいものをやると、なぜかそれ以下のものは簡単に思えてくるものです。

困難なものにチャレンジするからこそモチベーションが上がるし、それなりの努力もする。そして間違える問題は常に間違いやすいのは何故でしょうか？それは思い込みや固定概念が邪魔しているのです。逆に最初から解った問題はいつでも解る問題と言えます。時間の効率から言って、二度とやらくて良いでしょう。一度でも間違えた問題番号に丸でもして、正解したら斜線を引く。一度間違えた時の丸が見えなくなるまでやる」....のだそうです。私は出来ないけど、慶応に行った知り合いがいつもやっていた実践例です。がんばってくださいね（＾＾）。あと漫画だろうが文庫本だろうが、興味のある活字を見たり、ブログも有効かもしれませんねー。

近道を探しているのでしょうが

そんなものありません。
短期間では無理ですよ。
1000以上あるのだから一日三個ぐらい覚えて一年でクリアできますが
一か月で終えるには毎日36個覚えねばならない。
それは不可能です。

検定を受けるために勉強しても手遅れじゃないでしょうか

漢字の数は大変に多いので日常漢字に親しんでおいて検定のためには日常使わない字だけを勉強すればいいのです

高校３年生とのことですが、６級（小５相当）でどのくらいわからない漢字がありましたでしょうか？また、「書けない」のか「読むこともできない」のか、どちらでしょう？

もしなんらかの理由で中学校も高校もほとんど授業に出なかったし、本も全然読まない（漫画も含めて）生活だった、というのであれば、順を追って６級の問題集からはじめたほうがよさそうですが、一応授業には出ていたし、そこそこ本も読む、という場合であればいきなり３級からのほうが効率がいいかと思います。

ましてや目標が合格ではなく、常用漢字を理解することであれば、ね。
体系的に覚えられるほうが効率もいいですし、身につきやすいです。
漢字検定以外にも、高校受験用の漢字問題集などもおもしろいですよ。