お客様から受けた返金の記帳について。

私が思うに、お客様から振り込まれた「送料」は、そのまま発送運賃になるわけですから、運賃の預かりで処理された方がよかったのかもしれませんね。

来年からはそうされたらどうですか？
つまり、
商品代1050円（税込）と送料500円を振り込まれたとします。
（普通預金）1050　（売上高）1050　　　○○様（△△商品代）
（普通預金） 500　（預り金） 500　　　○○様送料分

後日発送する時、
（預り金）　500　　(現金）　500　　　　EXPACK500　○○様分

です。これは、送料はお客様負担なので、こちらの損益には関係しないという考え方によるものです。

ですが、既にこれまでは、送料の入金を「雑収入」という収益科目で処理しているので、運賃支払の時には、「荷造運賃」という費用科目を使って差し引きゼロにするしかないです。

ご質問のケースでは、25円多く頂いてしまったので、その返金する処理ですが、
まず収益の25円分を差し引かないといけないですから、
（雑収入）　25　（普通預金）　25　　　○○様 過入金返金
という逆仕訳をしたらいいと思います。
で、25円を返金するのに、金融機関の振込手数料が掛かると思うので、
それは、費用科目を使って仕訳すればいいです。
例えば、
（支払手数料）　105　　（普通預金）　　105　　振込手数料
の様な感じで（どういった勘定科目を使っているかわかりませんでしたので、オーソドックスな仕訳例を例示しました）

来年から預り金を使うとしたら、
最初に書いた様に、
送料入金時に、
（普通預金）　xxxx　　（預り金）　xxxx ○○様送料分

商品発送時に
（預り金）　　xxxx　　（現金）　xxxx　　EXPACK500　○○様分

もし、今回の様な返金があったとしたら、
（預り金）　xxxx （普通預金） xxxx ○○様　過入金返金
（支払手数料） xxxx （普通預金）xxxx　　　振込手数料

でよいでしょう。

雑収入２５円／現金２５円（送料差額返金）でいいと思います。