JRから地下鉄に乗り継ぐ定期券(2)

来月職場が移転することになり、いままでは通勤にJRしか利用していなかったのですが、今度はJR→営団地下鉄→都営地下鉄と乗り継ぎます。
JR⇔営団地下鉄⇔東西線と乗り継ぐのですが、定期の買い方について先ほど↓で質問させていただき、
http://oshiete1.goo.ne.jp/kotaeru.php3?q=819374
・JR
・営団地下鉄＋都営地下鉄
の2枚の定期を持とうと思っています。
しかし、JR⇔営団地下鉄に乗り継ぐ際、（途中に改札がない為）改札を通らないので、この定期の買い方だと改札に入ったり出たりするときに、いつも引っかからないか心配です。
安くて良い買い方でいい方法はないでしょうか？
よろしくお願いいたします。