本籍を入居予定のマンションの住所にできますか？

婚姻届はもう手に入れましたか？

これを見ると、新住所を書く欄はありません。
届けを出す際にも住民票は必要ありません。
書く必要があるは結婚前の本籍と住所、そして新本籍の場所です。（提出書類は結婚前の二人それぞれの戸籍抄本も必要。）

ですので婚姻届を出す（入籍日）際には、『本籍地は新居予定地・現住所はお互いの今住んでいる住所を書いて提出』で問題ありませんよ！

もちろん同時に住民票も変更した方が楽ですね。
住民票の変更は、まずお互いの旧住所市町村役場でそれぞれ『転出届』をもらいます。
それを新住所市町村役場に持って行き、『転入届』を書いて提出します。
転出届をもらってから、転入届を出すまではたしか２週間くらい猶予があったと思いますのでまずは転出届を手に入れましょう。

免許の書き換えに関しては、住民票の変更がなされてからでないとできません。
転入届を提出するとすぐ新住民票を手に入れることができます。
それを持って免許の書き換えに行きましょう。

本籍と現住所をごっちゃに考えていませんか。

既に回答が出ているように、

本籍は、日本全国何処でも構いません。皇居所在地であろうと、国後、択捉も近頃は認めているようです。ここに戸籍原本がおかれるので、戸籍謄本はその所在地の市町村が管理することになります。

住民登録は、現に居住している市町村に行なうもので、入籍日から数週間は新居に現住するまでは、そこに住民登録をすることは厳密には違法になります。

まぁ実際のところ、自分の経験では、婚姻に際しての新戸籍の本籍は、自分の本籍地にしました (後々戸籍謄・抄本を取るのが面倒になるので)。現住所は二人ともそのまま (つまり別で) 2 ヵ月後に引っ越した際に、転出・転入の処理を行ないました。これで一向に支障はありません。

また運転免許証の書き換えは、あくまでも住民登録法が前提ですので、実家に現住中に行なうことは、上記のように違法になります。

また運転免許証の書き換えは、あくまでも住民登録法が前提ですので、実家に現住中に行なうことは、上記のように違法になります。また慣例的に行なわれているようですが、住民登録変更後、運転免許証の住所変更を速やかに行なわず更新時にあわせて行なう、と言うのも同様に厳密には違法になります。

免許の書き換えは、新住民票持って警察署に行けば、その場で裏に書いてくれます。

まぁ、免許の更新の時でいいんですけどね。
その場合も、新住民票持って行けばいいです。

#1さんも書いておられるとおり、本籍はどこでもいいので何の問題はないです。

私の知人は入籍までに新居が決まらず、
本籍はご主人の現住所（実家）で、
現住所はそれぞれの現住所で出したようです。

でも、何度も役所に行くのは面倒ではないですか？
彼氏さんは、入籍時に住民票を一緒に移してしまっていいと思います。
wamicaさんは引越しがまだ先になるとのことですが、
引越し日が数ヶ月以上も先で、住民票は当分今のままでないと都合が悪い、
（例えば選挙が近いとか、税金の関係とか・・・）
というのなら住所は今のままで、
そうでないのなら、住民票も一緒に移してしまっても
いいのではないでしょうか。

以上、ご参考までに。。。

婚姻届を出す時に、住民票の異動、本籍も移動でいいんじゃないでしょうか。

普通みんなそうやってます。
結婚式＝結婚ではないです。
面倒など何も起こらないと思いますが、年度をまたぐ、年末をまたぐと、住民税や、選挙権などに影響するかも知れません。気にしなきゃいいだけですが。

本籍はどこでも大丈夫です。

ディズニーランドでも皇居でもOKです。